ARVO 2024 presentations

Our colleagues and collaborators gave presentations at the annual meeting of the Association for Research in Vision and Ophthalmology (ARVO 2024).

Here, we share our presentation posters. I hope you enjoy them!

Deep learning-based scatterer density estimation reveals age-related reduction of scatterers in inner retinal layers

presented by Praew, Thitiya Seesan

>> Poster (PDF version)

Toward in vivo cellular retinal imaging by standard-speed optical coherence tomography without adaptive optics

presented by Shuichi Makita
>> Poster (PDF version)

Three-dimensional evaluation of retinal autofluorescence imaging with

presentd by Masahiro Miura (to be sahred soon).

synthesized multi-contrast polarization-sensitive OCT imaging

Evaluation of RPE damage in AMD using synthesized polarization-sensitive OCT imaging

presented by Kosei Yanagida (to bo shared soon).

筑波大学COG研究紹介 2022年版

 私たちの最近の研究を紹介するビデオを公開します。

私たちの研究室では「計算光学顕微鏡」(Computationally augmented optical coherence microscopy) という技術・装置の開発・研究を行っています。この技術は光学イメージング技術と情報処理技術を組み合わせることで従来計測することのできなかった生体の様々な機能、形態を可視化するものです。

今回の紹介ビデオでは、計算光学顕微鏡が実現する生体イメージングのうち、分子標的なしに（ラベルフリーに）生体の活動三次元的に可視化する技術を紹介しています。

きれいな画像を堪能してください！

OCTを学ぶためのリンク集 （OCT講習会資料・関連リンク）

 

※ 研究室参加希望者オススメ記事

本日(2022年11月30日) 行われる「OCT講習会」で私達のグループの安野が「安野流! OCTの理解: Cascading encoder-decoder model で理解する光コヒーレンストモグラフィー」と題したチュートリアル＋技術モデル講演を行います。

このトークは低コヒーレンス干渉、統計的信号処理、医用画像処理、AIによる自動診断などを内包した「現代的なOCT装置」を「巨大なカスケード（多段構成）された符号化-復号化装置」として分析していくものです。テーマに比べてトーク時間が短いため、技術的な詳細にあまり時間がさけません。そこで、この講演の資料やさらにOCTについて学習するためのリンクをまとめます。たくさんあるので全部見るのは大変ですが、興味のある方はつまみ食いだけでもしてみてください。

OCT技術に関する資料

• 講演資料（パワーポイント） at Yasuno's Cabinet
• 初心者向けの短い教科書 「Tutorial on OCT」 at Yasuno's Cabinet
• ビデオレクチャー「Fundamentals of OCT」
  （全5回 筑波大学大学院講義） at Yasuno's YouTube channel
  ※英文ですが、non-native を対象としているため英語が得意でないひとでも大丈夫だと思います。
• 初心者向けOCTレクチャー資料（パワーポイント) at Yasuno's Cabinet

認識論的計測学に関する資料

• 認識論的計測学 レクチャービデオ (2021) at Yasuno's YouTube channel
  
• 認識論的計測学によるOCT批判（英文 preprint 論文) at arXiv
  https://doi.org/10.48550/arXiv.2211.05707 (2022).

※ 2021年のビデオと 2022年の論文では論理構成が多少異なります。2022年版ではあらたに「オブジェクト統制」という概念を導入することにより、認識論哲学との類似性に頼らずに計測行為の整理を行っています。

その他関連ページ

• 安野の YouTube channel
  筑波大学における講義、研究発表・解説ビデオなどを公開しています。
  シリーズ化された講義はチャンネル内の Playlist でまとめてあります。「論文の読み方」など、OCTとは直接関わらない研究チュートリアルなども公開しています。最大のヒット作はなぜか「確率論」です。
• Yasuno's cabinet (web-site)
  主にグループ内教育用に書かれたテキストや、グループ内外でのチュートリアル講演で用いた資料を公開しています。また、「論文の書き方」(Card-based paper writing) などの一般的な研究テキストも公開しています。

written by Yoshiaki Yasuno

Seminar talk: 光と信号処理で見る生体の機能と形態

筑波大学イノベイティブ計測技術開発研究センター主催のセミナーにおいて安野が最近の研究「計算光学顕微鏡（Computationally augmented optical coherence microscope)」について講演を行いました。ビデオを公開します。これまでまとめて日本語で話す機会がなかった、私たちの最近の研究成果を概観しています。長丁場のセミナートークですが、ぜひお楽しみください。

トーク冒頭では、私たちの研究グループ（Computational Optics Group）を紹介しています。

また、トークの最後では、私（安野）から筑波大学に関わるすべての人たちへのメッセージが含まれています。

YouTube「光と信号処理で見る生体の機能と形態＋「認識する計測」: Computationally Augmented OCT Microscope」（別ウィンドウが開きます）

※　講演時間の都合で深層学習を使った「構成的計測」と「高精度・高機能眼底イメージング」は含まれていません。「構成的計測」は近々いちどまとめたいと思います。「高精度・高機能眼底イメージング」はひとまずこのショートトーク（英語版10分 YouTube）をお楽しみください。

Update: 私たちの研究

私たちの行っている研究を解説したページ "Research"  に２つのセクションを加えました。

• Step 2. Our vision and project
• Step 3. Further reading

です。Step 2. では今まさに私達が取り組んでいる研究プロジェクトについて解説しています。また、Step 3. では、さらに私たちの研究分野について勉強したい方のために教科書、論文を紹介しています。

ぜひ一度のぞいてみてください。

安野嘉晃

Step-by-step method for scientific paper writing

Yasuno recently released a short instruction article of a step-by-step method to write a scientific paper. This article was originally written to teach his students the way of scientific writing. In this instruction, he discusses a purpose of scientific writing and a detailed way to construct a logic of the paper.

The instruction is distributed under a Creative Commons Attribution No Derivatives 3.0 License (CC BY-ND 3.0), and hence you can freely read it, use it for your teaching, and also can distributed. Although you don't need to obtain any permission to use/re-distribute this document, any criticism and positive feedback are also welcome.

The document is available on the following distribution site.
>> A Card-Based Method for Scientific Paper Writing

2012-08-15

Joschi, Yoshiaki Yasuno

Yasuno became associate editor of Optics Express

Our colleague Yoshiaki Yasuno became an associate editor of Optics Express. Optics Express is organized by Optical Society of America, and is one of the highest impact journals in the field of optics. Yasuno edits papers mainly of biomedical optics.

People

Faculty staff

• Yoshiaki Yasuno (Assistant Professor, Group Leader)
• Shuichi Makita (Assistant Professor)

PhD candidates

• Arata Miyazawa
• Young-Joo Hong
• Kazuhiro Kurokawa
• Duan Lian

Secretary

• Chie Yoshinaga

External members

• Masahiro Miura (MD, Associate Professor from Tokyo Medical University)

About us

The computational optics group (COG) was formed in 1999 as a division of applied optics laboratory, institute of applied physics, university of Tsukuba. On that moment we were not COG but spatio-temporal optics group, and our main research subject was spatio-temporal optical computing.

In 2000, we started a optical measurement project using spatio-temporal optical computing technologies, and in 2002, we changed our direction to more computationally.

Since 2002, our main research interest is computer assisted optical measurment. We are trying to introduce computational technologies into optical measurement.

Since 2007, we are an independent research group and no longer a part of Applied Optics Laboratory of University of Tsukuba.

Contact and Access

Map

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Access to COG Office

From Tokyo:

1. Take Tsukuba Express train to Tsukuba station.
2. Take a bus to Tsukuba-Daigaku-Chuo (Center of Tskuba University, 筑波大学中央) or Tsukuba-Daigaku-Junkan Migi-Mawari (Tsukuba University Shuttle/Right circular path, 筑波大学循環右回).
3. The closest bus-stop to our office is Daisan-Eria-Mae (3rd Area of the University, 第3エリア前). When you get off the bus, you'll see a tall brown building (Building-F of Institute of Engineering, 工学系F棟). Our office is at the 7th floor of this building, room 702. Note that the frequency of the bus is around every 10-15 min.

From Narita (New Tokyo) Airport:

1. There is a direct bus to Tsukuba bus-center (next to Tsukuba station). From Narita to Tsukuba, reservation is not required, and you can buy a bus ticket at Narita Airport. The timetable is available on this page.
2. From Tsukuba bus-center, take a bus to Tsukuba-Daigaku-Chuo (Center of Tskuba University, 筑波大学中央) or Tsukuba-Daigaku-Junkan Migi-Mawari (Tsukuba University Shuttle/Right circular path, 筑波大学循環右回).
3. The closest bus-stop to our office is Daisan-Eria-Mae (3rd Area of the University, 第3エリア前). When you get off the bus, you'll see a tall brown building (Building-F of Institute of Engineering, 工学系F棟). Our office is at the 7th floor of this building, room 702. Note that the frequency of the bus is around every 10-15 min.

From Haneda (Tokyo) Airport:

1. There is a direct bus to Tsukuba bus-center (next to Tsukuba station). From Haneda to Tsukuba, reservation is not required, and you can buy a bus ticket at Haneda Airport. The timetable is available on this page.
2. From Tsukuba bus-center, take a bus to Tsukuba-Daigaku-Chuo (Center of Tskuba University, 筑波大学中央) or Tsukuba-Daigaku-Junkan Migi-Mawari (Tsukuba University Shuttle/Right circular path, 筑波大学循環右回).
3. The closest bus-stop to our office is Daisan-Eria-Mae (3rd Area of the University, 第3エリア前). When you get off the bus, you'll see a tall brown building (Building-F of Institute of Engineering, 工学系F棟). Our office is at the 7th floor of this building, room 702. Note that the frequency of the bus is around every 10-15 min.

Contact

• Phone/Fax: +81-29-853-5217
• E-mail: cogoffice@optlab2.bk.tsukuba.ac.jp
• Institute of Applied Physics, University of Tsukuba, Tennodai 1-1-1, Tsukuba, Ibaraki, 305-8573, Japan